一、检察院负责侦查的部门调查核实后怎样处理
1、检察院负责侦查的部门调查核实后。应当制作审查报告。调查核实终结后，相关材料应当立卷归档。立案进入侦查程序的，对于作为诉讼证据以外的其他材料应当归入侦查内卷。
2、法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第一百七十条
二、检察院调查取证程序是什么
关于调查取证的方式，一般是非强制性的，只有当审判人员涉嫌职务违法犯罪时，才使用诸如侦查的强制性手段。司法实践中，检察机关的调查取证方式主要有:
1、询问。即检察机关向当事人或者案外人询问情况，制作笔录。
2、查询。即检察机关向有关单位查询情况，由有关单位出示相关证据材料。
3、鉴定、勘验。即检察机关对与案件有关的专门性问题，委托有鉴定资格的机构进行鉴定。对应当勘验现场或勘验物证而法院没有勘验的，检察机关可以进行勘验并制作勘验笔录。
4、初查与侦查。这种方式主要是针对审判人员职务违法犯罪而言的。