五、写出下列物质的中文名称并阐明该物质在生化中的应用(共8分)
DNS-C1
DNFB
DEAE—纤维素 BOC基
1、DNS-Cl: 5一二甲氨基萘-1-磺酰氯,用作氨基酸的微量测定,或鉴定肽链的N—端氨基酸。
2、DNFB:2,4一二硝基氟苯,鉴定肽链的N—端氨基酸。
3、DEAE一纤维素: 二乙氨基乙基纤维素,阴离子交换剂,用于分离蛋白质。 4、BOC基: 叔丁氧羰酰基,人工合肽时用来保护氨基酸的氨基。
六、解释下列名词(共12分)
1、肽聚糖:肽聚糖是以NAG 与NAM组成的多糖链为骨干与四肽连接所成的杂多糖。
2、蛋白质的别构效应:含亚基的蛋白质由于一个亚基的构象改变而引起其余亚基和整个分子构象、性质和功能发生改变的作用称别构效应。
3、肽平面:由于肽键不能自由旋转,形成肽键的4个原子和与之相连的2个α-碳原子共处在1个平面上,形成酰胺平面,也称肽平面。
4、两面角:由于肽链中的Cα-N键和Cα—C键是单键,可以自由旋转,其中绕Cα-N键旋转的角度称φ角,绕Cα-C键旋转的角度称ψ角,这两个旋转的角度称二面角。
5、波耳效应:pH的降低或二氧化碳分压的增加,使血红蛋白对氧的亲和力下降的现象称波耳效应。
6、碘价:100克脂肪所吸收的碘的克数称碘价,碘价表示脂肪的不饱和度。
七、问答与计算(共30分)
1、今从一种罕见的真菌中分离到1个八肽,它具有防止秃发的作用。经分析,它的氨基酸组成是:Lys2,Asp1,Tyr1,Phe1,Gly1,Ser1和Ala1。此八肽与FDNB反应并酸水解后。释放出FDNB-Ala。将它用胰蛋白酶酶切后,则得到氨基酸组成为:Lys1,Ala1,Ser1和Gly,Phe1,Lys1的肽,还有一个二肽。将它与胰凝乳蛋白酶反应后,释放出游离的Asp以及1个四肽和1个三肽,四肽的氨基酸组成是:Lys1,Ser1,Phe1和Ala1,三肽与FDNB反应后,再用酸水解,释放出DNP-Gly。请写出这个八肽的氨基酸序列。(10分)Ala-Ser-Lys-phe-Gly-Lys-Tyr-Asp 2、试求谷胱甘肽在生理pH时带的净电荷,并计算它的等电点。已知pK(COOH)=2.12 pK(COOH)=3.53 pK(N+H3)=8.66 pK(SH)=9.62 净电荷为-1,PI2.123.532.832
3、若有一球状蛋白质,分子中有一段肽链为Ala-Gln-Pro-Trp-Phe-Glu-Tyr-Met… 在生理条件下,哪些氨基酸可能定位在分子内部?(5分)
球状蛋白质形成亲水面,疏水核,所以Ala,Pro,Trp,phe,Met可能定位在分子内部。
4、根据你所学的知识推断人工合成胰岛素是先合成A链、B链再连接成胰岛素
还是先合成“工”字形肽,再连接成胰岛素?并解释其理由。(5分)
因为一级结构决定高级结构,所以人工合成胰岛素时先合成A链、B链再连接成胰岛素。
试卷二
四 名词解释(每个3分,共24分)
1.蛋白聚糖 是由糖胺聚糖以共价键与肽链连接形成的结合蛋白质。
2.必需脂酸 指人体不能合成而需要由食物提供的脂肪酸 ,包括亚麻酸、亚油酸和花生四烯酸。
3.肽平面 肽链主链的肽键C-N具有双键的性质 ,因而不能自由旋转,使连接在肽键上的6个原子共处于一个平面上,称为肽平面。
4.结构域 在较大的蛋白质分子中,多肽链的三维折叠常形成2个或多个松散连接的近似球状的三维实体。这些实体称为结构域
5.同源蛋白质 在不同的机体实现同一功能的蛋白质称为同源蛋白质
6.糖的变旋现象 变旋现象指一个具有旋光性的溶液放置后,其比旋光度改变的现象,具有α-和β-异构体的糖才具有变旋现象。
7.别构效应 又称为变构效应,当某些寡聚蛋白质与别构效应剂发生作用时,可以通过蛋白质构象的变化来改变蛋白质的活性,这种改变可以是活性的增加或减少。
8.差向异构体 仅仅只有一个不对称碳原子的构型不同的光学异构体 五 问答题(每题9分,共36分)
1.在体外,用下列方法处理对血红蛋白与氧的亲和力有什么影响? (1)pH从7.0增加到7.4 pH增加,血红蛋白与氧的亲和力增加
(2)CO2分压从10torr增加到40torr CO2分压增加,血红蛋白与氧的亲和力下降
(3)O2分压从60torr下降到20torr O2分压下降,血红蛋白与氧的亲和力下降
(4)2,3-二磷酸甘油酸的浓度从8X10-4mol/L 下降到2X10-4mol/L 2,3-DPG浓度下降,血红蛋白与氧的亲和力增加
(5)α2β2解聚成单个亚基 α2β2解聚成单个亚基,血红蛋白与氧的亲和力增加
2.试计算含有122个氨基酸残基的多肽链呈完全伸展时的长度是多少?该蛋白
质的分子量大约是多少?
每一个氨基酸残基在β-折叠结构中的长度为0.36nm,因此该肽链的长度为 43.92nm。氨基酸残基的平均分子量为120,因此该蛋白质的分子量为140。 3.从鳄梨中提取出一种甘油三酯的样品5g,需要0.5mol/L KOH 36.0m1才能完全
水解并将其脂酸转变为肥皂。试计算样品中脂酸的平均链长。
16.7个碳原子
4.
上述化合物中(1)哪个是半缩酮形式的酮糖?(2)哪个是吡喃戊糖?(3)哪个是糖苷?(4)哪个是α-D-醛糖? (1)C (2) D (3)E (4)B
试卷三
四、名词解释
1核酸的减色效应:变性的核酸在一定条件下,恢复到原来的结构(即复性),紫外吸收减小,ε(p)恢复到原来的水平。
2摆动假说:密码子和反密码子配对时,密码子中前面两个碱基特异性强,是标准碱基配对,但第三个碱基配对时,就不那么严格,有一定的自由度,除了标准配对外,还有一些非标准配对。
3Tm值:DNA双螺旋失去一半时的温度。
4同工酶:指能催化同一种化学反应,但其酶蛋白本身的分子结构、组成有所不同的一组酶。
5Northern印迹:将变性RNA转移到纤维素膜上后,与单链DNA进行杂交。 6基因:编码蛋白质或RNA的DNA序列。
7Z-DNA:美国Rich等发现的左手螺旋DNA,由于左手螺旋DNA分子中糖—磷酸主链呈“Z”字形向左盘绕,因而被称为Z-DNA。 五、问答与计算(共40分):
1、用系统名称命名催化下列反应的酶(5分)
(1)ATP+AMP ADP+ADP
CH3COSCoA+AMP+PPi
(2)CH3COOH+CoASH+ATP (1)ATP:AMP磷酸基转移酶(或ATP:AMP磷酰基转移酶) (2)乙酸:CoA合成酶(形成AMP)
2、为什么RNA易被碱水解,而DNA不易被碱水解?(5分)
因RNA分子中含核糖,碱水解时先形成2′,3′一环状核苷酸,再进一步水解成2′一核苷酸和3′一核苷酸的混合物。 而DNA含D—2—脱氧核糖,不能形成2′,3′一环状核苷酸。
3、有哪些方法可区分同样分子量的单链DNA和单链RNA?(5分)
(1)因DNA分子含D—2—脱氧核糖,RNA分子中含核糖,所以可用二苯胺法和苔黑酚法区分同样分子量的单链DNA和单链RNA。 (2)用特异的核酸酶
(3)RNA易被碱水解,DNA不被碱水解。 (4)浮力密度
(5)酸水解后,接下来层析,DNA分子中含胸腺嘧啶,RNA分子中不含胸腺嘧啶而含尿嘧啶。
4、(1)降低溶液的离子强度;(2)加少量乙醇到溶液中将如何影响双链DNA的熔点?(5分)(1)使Tm值下降。(2)使Tm值下降,破坏氢键。 5、试举三例说明维生素和辅酶的关系,并指出这些辅酶的组成和功能。 维生素 B2 B2 辅酶 FMN FAD 辅酶的组成 磷酸 异咯嗪、核糖醇、 脱氢酶的辅酶 腺嘌吟、核糖、 磷酸 B5(维生素PP)
6、设有一抑制剂,当其浓度为2.5×10-4mol/L,底物浓度为0.001mol/L或0.1mol/L时均能抑制酶活力25%,已知酶浓度为1.0×10-7mol/L,Ks为100mol/L。求: (1)竞争性抑制还是非竞争性抑制 (2)计算Ki
(3)若抑制剂浓度加倍,抑制程度如何? (4)抑制剂对Ks的影响如何?(10分) (1)非竞争性抑制 (2)Ki=7.5×10-4M (3)40% (4)无影响
NAD(或NADP) 烟酰胺、腺嘌吟 核糖、磷酸 脱氢酶的辅酶 辅酶的功能 异咯嗪、核糖醇、 脱氢酶的辅酶 试卷四
1减色效应 当加热变性了的核酸分子,在退火的条件下发生复性时,其在
260nm处的紫外吸收会减少的现象称为减色效应。
2分子杂交 当两条不同来源的DNA(或RNA)链或DNA链与RNA链之间存在互补顺序时,在一定条件下可以发生互补配对,形成双螺旋分子,这种分子称为杂交分子。形成杂交分子的过程称为分子杂交。
3酶的比活力 即酶含量的多少,定为每毫克酶蛋白所具有的酶活力单位,一般用U/毫克蛋白质表示。
4调节酶 在多酶体系中,某些酶因其本身活性受到严格的调节控制,从而对代谢反应起调节作用,此类酶称为调节酶。
5同工酶 指催化同一化学反应,而其酶蛋白本身分子结构组成及理化性质有所不同的一组酶
6维生素原 某些物质本身不是维生素,但是可以在生物体内转化成维生素,这些物质称为维生素原。
7多磷酸核苷酸 5’-核苷酸的磷酸基进一步磷酸化成二磷酸核苷、三磷酸核苷或更多的磷酸核苷称为多磷酸核苷酸。
8酶的辅助因子 构成全酶的一个组分,主要包括金属离子及小分子有机化合物,主要作用是在酶促反应中运输转移电子、原子或某些功能基团。
期末试卷一
四、名词解释(每个名词2分,共10分)
(1)ribozyme (2)正协同效应 (4)分子伴侣 (5)顺式作用元件
3)SD序列 (
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